國家癲癇防治項目辦公室成立于2005年，由國家衛生部（現國家衛生健康委員會）依托北京市神經外科研究所建立，執行中央支持地方—農村癲癇防治管理項目。截至2023年底，農村癲癇防治管理項目總投入經費超過3億元，已覆蓋全國32省（直轄市、自治區、生產建設兵團）的超過350個區縣，覆蓋農村人口超過1.4億人。項目由社區/鄉鎮醫生在神經科醫生指導下，為符合納入條件的全身強直-陣攣性癲癇患者免費提供定期隨訪管理服務，迄今已累計治療管理癲癇患者超過12萬人。

國家癲癇防治項目辦公室的主要任務與職責如下：

1.配合國家衛健委完成農村癲癇防治管理項目的日常管理工作；

2.負責制定農村癲癇防治管理項目具體技術方案、培訓教材和項目質量控制標準；

3.承擔農村癲癇防治管理項目的資料收集、技術指導、督導工作；

4.聯合WHO完成癲癇和其它神經系統疾病跨部門全球行動計劃（IGAP）；

5.為國家衛健委癲癇的人群防治研究方面提供咨詢意見，并提出合理化建議；

6.積極開展人員培訓，建立完善的癲癇防治隊伍，提高基層對癲癇疾病的診療能力；

7.廣泛開展健康教育，普及癲癇知識，使公眾認識癲癇，減少社會對癲癇患者的歧視。