為滿足日益增長(zhǎng)的臨床需求，神經(jīng)病理中心一直積極開展分子病理檢測(cè)項(xiàng)目，尤其自2021年第五版WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類指南（簡(jiǎn)稱WHO CNS5）發(fā)布后，我們迅速啟動(dòng)了DNA甲基化譜分析項(xiàng)目，并與2023年7月在院內(nèi)通過(guò)了新技術(shù)新項(xiàng)目評(píng)審，正式進(jìn)入臨床檢測(cè)。
目前檢測(cè)平臺(tái)日益完善，包括焦磷酸測(cè)序平臺(tái)、熒光原位雜交平臺(tái)、熒光定量PCR平臺(tái)、二代測(cè)序平臺(tái)，以及具有獨(dú)立知識(shí)產(chǎn)權(quán)的國(guó)內(nèi)首個(gè)DNA甲基化譜分析平臺(tái)（該平臺(tái)既可以對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤進(jìn)行準(zhǔn)確分類，又可防止國(guó)人遺傳信息資源外泄），處于國(guó)內(nèi)中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢測(cè)的領(lǐng)先地位。現(xiàn)已完成分子病理檢測(cè)1萬(wàn)余例，為中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的診斷、分級(jí)、治療和預(yù)后評(píng)估提供了重要依據(jù)。
下面將神經(jīng)病理中心目前開展的分子病理檢測(cè)項(xiàng)目進(jìn)行簡(jiǎn)要介紹，并在文末附：中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢查流程（附件一）和WHO CNS5 指導(dǎo)下的神經(jīng)病理報(bào)告（附件二）。
目前神經(jīng)病理中心開展的分子病理檢測(cè)項(xiàng)目包括：
一、MGMT啟動(dòng)子甲基化
檢測(cè)方法：焦磷酸測(cè)序法（PSQ）
檢測(cè)意義：具有MGMT啟動(dòng)子甲基化的患者對(duì)替莫唑胺更加敏感
二、染色體缺失/擴(kuò)增、基因拷貝數(shù)缺失/擴(kuò)增及基因融合
檢測(cè)方法：熒光原位雜交法（FISH）
檢測(cè)內(nèi)容：目前開展的FISH項(xiàng)目包括染色體1p/19q缺失、7號(hào)染色體擴(kuò)增、基因拷貝數(shù)缺失/擴(kuò)增（CDKN2A、EGFR、MYCN、MDM2、CDK4等）、基因融合（MYC、CIC、RELA、MN1、FOXR2、EWSR1、BRAF等）。
三、神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤精準(zhǔn)診療基因檢測(cè)（V1.0）（DNA）
檢測(cè)方法：二代測(cè)序法
檢測(cè)內(nèi)容：該panel整合了多平臺(tái)多分子靶標(biāo)的高通量靶向測(cè)序項(xiàng)目，基因列表如下：
檢測(cè)意義： 1.預(yù)測(cè)診斷分型 2.預(yù)測(cè)臨床預(yù)后 3.預(yù)測(cè)藥物有效性
四、兒童腫瘤精準(zhǔn)診療基因檢測(cè)（DNA+RNA）
檢測(cè)方法：二代測(cè)序法
檢測(cè)內(nèi)容：該panel最大優(yōu)勢(shì)是包括＞1700種融合基因形式，基因列表如下：
檢測(cè)意義：1.預(yù)測(cè)診斷分型 2.預(yù)測(cè)臨床預(yù)后 3.預(yù)測(cè)藥物有效性
五、DNA甲基化譜分析
檢測(cè)方法：DNA甲基化譜分析法
檢測(cè)內(nèi)容：通過(guò)甲基化芯片檢測(cè)對(duì)全基因組935K個(gè)位點(diǎn)的甲基化水平進(jìn)行分析，并基于甲基化分析結(jié)果進(jìn)行中國(guó)人群數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，從而對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤進(jìn)行分類。
DNA甲基化譜分析結(jié)果包含了MGMT啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)（該結(jié)果是評(píng)價(jià)患者對(duì)替莫唑胺藥物敏感性的重要因素）、DNA甲基化譜聚類情況（該結(jié)果會(huì)提示腫瘤的分類情況，幫助醫(yī)生做出整合病理診斷）以及拷貝數(shù)變異情況（擴(kuò)增或缺失）。舉例如下：
檢測(cè)意義：WHO推薦的有效且重復(fù)性高的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類方法，可為腫瘤整合診斷提供重要的參考和依據(jù)。尤其對(duì)于組織特征不顯著、常規(guī)分子病理檢測(cè)無(wú)法明確以及罕見(jiàn)的腫瘤類型和亞型，DNA甲基化譜分析是（目前）確定其診斷的唯一方法。
附件
附件一：中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢查流程
值得注意的是，準(zhǔn)確的分子病理診斷離不開準(zhǔn)確的組織病理學(xué)診斷。標(biāo)本的病理評(píng)估極其重要，因?yàn)槟X腫瘤組織存在很大的異質(zhì)性，只有選出合適的病理蠟塊做分子病理檢測(cè)，才能保證分子病理報(bào)告的準(zhǔn)確性和可信性。
附件二：WHO CNS5 指導(dǎo)下的神經(jīng)病理報(bào)告
